A secção de pólo-aquático continuou na época 98/99 o projecto apresentado por um grupo de nadadores "mais antigos" na época anterior e que tem como objectivos a ligação de ex-nadadores ao clube, a formação de jogadores de pólo e em termos competitivos a representação no escalão maior da sua equipa.

Continuando as suas apostas, desenvolvendo um trabalho cada vez mais sério e apostando muito forte numa boa classificação no campeonato da 2ª divisão, teve como pontos mais altos os seguintes eventos:

Disputou e venceu o torneio de Abertura da Zona Norte, prova organizada pela ANNP, que contou com a participação dos seguintes clubes: - Apólos, Neptus, CDPenafiel, Guimarães, Lousada, Autad, Paredes, Rio Tinto e CNAc.

Fez-se representar no Campeonato Nacional da 2ª Divisão, participando na 1ª fase englobada na Zona Norte, e depois na 2ª Fase (apuramento do campeão nacional), disputando os jogos na Piscina Municipal de Penafiel. Foi vice-campeão regional e vice-campeão nacional da 2ª divisão.

Participou na Taça de Portugal

Organizou e venceu o 2ª Torneio de Pólo-Aquático do Cnac em 26 de Junho de 1999.
Foram convidadas as equipas da AAC, Paredes e Rio Tinto.

Participou-se no Torneio Internacional da AAC, realizado nos dias 9,10 e 11 de Julho, na Piscina Municipal de Coimbra.

A equipa foi orientada pelo treinador Marques Pereira e constituíram a equipa os seguintes jogadores:

- Miguel Faria	- Carlos Melo	- António Morais
- Bruno Martins	- João Coutinho	- Bruno Pita
- Tiago Santos	- Hugo Abade	- Alexandre Santos
- Nuno Roque	- Tiago Carneiro	- Filipe Rodrigues
- Pedro Bento	- João Tsukagoshi	- Bernardo Rodrigues
- Nuno Santos	- Ricardo Pereira	- Ricardo Silva
- Luís Teixeira	- João Caldinhas	- Luis Gaspar
- Luis Carvalho	- Duarte Cristino

Durante esta época promoveu-se o Pólo-Aquático feminino, tendo realizado alguns sessões de treino ao Sábado e durante a realização do 2º Torneio do Cnac efectuou-se uma pequena apresentação da equipa num mini jogo com a AAC.

Durante a realização do Torneio Internacional da AAC, realizaram-se mais dois jogos. Defrontaram-se as equipas da AAC e uma equipa espanhola.

RESULTADOS:

Torneio de Abertura da Zona Norte

1ª Jornada - CNAc - Gondomar 05 - 02
2ª Jornada - Lousada - CNAc 13 - 01
3ª Jornada - Guimarães - CNAc 06 - 04
4ª Jornada - Paredes - CNAc 01 - 11
5º Jornada - UTAD - CNAc 09 - 09
6º Jornada - Apolos - CNAc 02 - 05

Vencedor do Torneio de Abertura

Campeonato Nacional da 2ª Divisão - Zona Norte A

1ª Jornada - CNAc - NEPTUS 21 - 3
2ª Jornada - Rio Tinto - CNAc 9 - 12
3ª Jornada - Apolos - CNAc 7 - 7

Fase Final Zona Norte

Jogo 1º A x 2º B - Penafiel / CNAc 3 - 8
Apuramento vencedor - CNAc / Apolos 7 - 8

Vice Campeão da Zona Norte

Fase Final Campeonato Nacional da 2ª Divisão

1ª Jornada - CNAc - UTAD 08 - 13
2ª Jornada - Apolos - CNAc 07 - 08
3ª Jornada - CNAc - Portinado 12 - 07

Vice Campeão Nacional da 2ª Divisão
Nota: Subida à 1ª Divisão Nacional

Taça de Portugal

1ª Eliminatória - Isento
1/8 final - CNAc - Rio Tinto 18 - 6
1/4 final - AAC - CNAc 16 - 7

2º Torneio de Pólo-Aquático do Cnac - 26-06-99

1º Jogo - CNAc - Paredes
2º jogo - AAC - Rio Tinto
3º e 4º lugar - AAC - Paredes
1º e 2º lugar - CNAc - Rio Tinto

Venceu o Torneio a equipa do CNAc

Torneio Internacional da AAC - 9,10 e 11/07/99

CNLatina - CNAc - 21 / 02
CNAc - AAC - 04 / 09
Belenenses - CNAc - 09 / 08

Venceu o torneio o CNLatina

Pólo Aquático Feminino

Durante esta época constitui-se um grupo de pólo-aquático feminino, que realizava os seus treinos ao Sábado, das 18h às 20h, que deu os seues primeiros passos na modalidade.

Realizou 3 mini-jogos nos torneios de pólo-aquático do CNAc e AAC.

As jogadoras que constituíram o grupo foram:

- Sofia Roque	- Ana Sousa	- Joana Araújo
- Joana Crisóstomo	- Inês Cunha	- Vera Matos
- Andreia Marques	- Margarida Carvalho	- Inês Simões
- Cristiana Brinca	- Patrícia	- Ana Lúcia Gomes